Infraestructuras ferroviarias
En la actualidad, la Agencia gestiona, tanto de modo directo como indirecto, los metros de Sevilla, Málaga y Granada y el Tranvía de la Bahía de Cádiz (Trambahía), en explotación comercial. Ha intervenido además en las actuaciones realizadas hasta la fecha en otros sistemas de transporte ferroviario, como el Tranvía de Jaén y el Eje Ferroviario Transversal de Andalucía (entre Marchena y Santa Ana):